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微生物多样性测序 内容简介 微生物多样性测序 微生物多样性测序,又称扩增子测序,是利用二 / 三代测序平台,以细菌 / 古菌 16S rRNA 基因可变区、真菌 18S rRNA 基因可变区或真菌 ITS ( Inter···
微生物多样性测序
微生物多样性测序
微生物多样性测序,又称扩增子测序,是利用二/三代测序平台,以细菌/古菌16S rRNA基因可变区、真菌18S rRNA基因可变区或真菌ITS(Internal transcribed spacer)内转录间隔区等微生物特征序列(Signature sequence)为靶点,通过检测序列的变异和数量,反映菌群中各类微生物的种类和丰度,从而快速解码菌群物种分布特征,阐明样本间多样性和组成差异。
测序流程
1.样本总DNA提取
2.DNA质检
3.设计合成引物接头
4.目的片段PCR扩增与产物回收纯化
5.构建PE文库
6. Illumina PE250/300测序平台
7.生信分析
部分结果展示:
微生物多样性测序
内容简介
微生物多样性测序,又称扩增子测序,是利用二/三代测序平台,以细菌/古菌16S rRNA基因可变区、真菌18S rRNA基因可变区或真菌ITS(Internal transcribed spacer)内转录间隔区等微生物特征序列(Signature sequence)为靶点,通过检测序列的变异和数量,反映菌群中各类微生物的种类和丰度,从而快速解码菌群物种分布特征,阐明样本间多样性和组成差异。
测序流程
1.样本总DNA提取
2.DNA质检
3.设计合成引物接头
4.目的片段PCR扩增与产物回收纯化
5.构建PE文库
6. Illumina PE250/300测序平台
7.生信分析